В 1.1.0 нет системы автоматического обновления; обновление выполняется вручную.
config/config.php, storage/ (логи, файл блокировки) и public/uploads/ (загруженные изображения).При проблемах восстановите файлы и базу из резервной копии. Поскольку миграции только добавляют, старая версия обычно может работать с новыми таблицами/столбцами, но это указывается в CHANGELOG для каждого релиза.